磁盤進行讀寫操作的物理單位是：扇區(qū)。操作系統(tǒng)以扇區(qū)為單位對磁盤進行讀/寫操作，扇區(qū)是磁盤存儲信息的最小物理單位。
扇區(qū)，是指磁盤上劃分的區(qū)域。磁盤上的每個磁道被等分為若干個弧段，這些弧段便是磁盤的扇區(qū)，硬盤的讀寫以扇區(qū)為基本單位。
磁盤的每一面被分為很多條磁道，即表面上的一些同心圓，越接近中心，圓就越小。
而每一個磁道又按512個字節(jié)為單位劃分為等分，叫做扇區(qū)，在一些硬盤的參數(shù)列表上你可以看到描述每個磁道的扇區(qū)數(shù)的參數(shù)，它通常用一個范圍標識，例如373～746，這表示，最外圈的磁道有746個扇區(qū)，而最里面的磁道有373個扇區(qū)，因此可以算出來，磁道的容量分別是從186.5kb到373kb(190976b–381952b)。
磁盤驅(qū)動器在向磁盤讀取和寫入數(shù)據(jù)時，要以扇區(qū)為單位。
在磁盤上，dos操作系統(tǒng)是以“簇”為單位為文件分配磁盤空間的。硬盤的簇通常為多個扇區(qū)，與磁盤的種類、dos 版本及硬盤分區(qū)的大小有關(guān)。
每個簇只能由一個文件占用，即使這個文件中有幾個字節(jié)，決不允許兩個以上的文件共用一個簇，否則會造成數(shù)據(jù)的混亂。
這種以簇為最小分配單位的機制，使硬盤對數(shù)據(jù)的管理變得相對容易，但也造成了磁盤空間的浪費，尤其是小文件數(shù)目較多的情況下，一個上千兆的大硬盤，其浪費的磁盤空間可達上百兆字節(jié)。
為了對扇區(qū)進行查找和管理，需要對扇區(qū)進行編號，扇區(qū)的編號從0磁道開始，起始扇區(qū)為1扇區(qū)，其后為2扇區(qū)、3扇區(qū)……，0磁道的扇區(qū)編號結(jié)束后，1磁道的起始扇區(qū)累計編號，直到最后一個磁道的最后一個扇區(qū)（n扇區(qū)）。
例如，某個硬盤有1024個磁道，每個磁道劃分為63個扇區(qū)，則0磁道的扇區(qū)號為1~63，1磁道的起始扇區(qū)號為64最后一個磁道的最后一個扇區(qū)號為64512。
硬盤在進行扇區(qū)編號時與軟盤有一些區(qū)別，在軟盤的一個磁道中，扇區(qū)號一次編排，即1、2、3……n扇區(qū)。由于硬盤的轉(zhuǎn)速較高，磁頭在完成某個扇區(qū)數(shù)據(jù)的讀寫后，必須將數(shù)據(jù)傳輸?shù)轿C，這需要一個時間，但是這時硬盤在繼續(xù)高速旋轉(zhuǎn)，當數(shù)據(jù)傳輸完成后，磁頭讀寫第二個扇區(qū)時，磁盤已經(jīng)旋轉(zhuǎn)到了另外一個扇區(qū)。因此在早期硬盤中，扇區(qū)號是按照某個間隔系數(shù)跳躍編排的。
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